Bejelentkezést követően a felület bal felső részéből érhető el a menü. A Menüben lehet megtalálni a különböző, tanulmányokhoz kapcsolódó funkciókat, információkat.
Kedvencek
A menüben a Kedvencek lehetőséget választva kedvencként lehet jelölni menüpontokat. A Kedvencek szerkesztése gomb megnyomását követően a csillag ikonokkal lehet kiválasztani a kedvenc menüpontokat, melyek ezt követőn a Kedvencek megjelennek a kedvencek főmenüben is.
A Neptun rendszerben a felsőoktatási intézmények eltérő működése miatt intézményenként változhatnak az elérhető menüpontok és funkciók.